サモス島のヘラ神殿は、女神ヘラにささげられた大規模な聖域である。ギリシャのサモス島に位置し、古代サモス市、現在のピタゴリオから南西へ約6キロメートル、イムブラソス川が海へ注ぐ地点に近い低湿地の盆地に築かれた。
聖域に建てられたアルカイック時代後期の神殿は、独立して建つ巨大なイオニア式神殿の最初期例の一つだった。しかし、この地の祭祀建築の歴史はさらに古く、先行する建物は紀元前8世紀の幾何学様式期、あるいはそれ以前にまでさかのぼる。
サモス島のヘラ神殿は、巨大イオニア式神殿の先駆けとなった古代ギリシャの聖域。ピタゴリオとともに世界遺産に登録されている。