ヤシュチランは、メキシコのチアパス州、ラカンドンの熱帯雨林に囲まれたウスマシンタ川の岸にあります。道路からそのまま到着できる考古学地区とは異なり、一般的な訪問ルートはフロンテラ・コロサルまで陸路で進み、そこから小舟で川をさかのぼって遺跡へ向かいます。船旅も訪問の一部です。緑に包まれた川辺から建物が現れ、古代都市を形づくった水路が今も到着方法を決めています。
都市の配置は自然環境に深く結び付いています。大広場は川沿いの自然の段丘にあり、大アクロポリスと西アクロポリスは南側の石灰岩の丘に築かれました。広場や神殿、高所の居住・儀礼区画が一つの都市景観をつくります。歩いてみると遺跡の広がりが分かります。階段や小道が川面より高い位置にある建物を結び、遠くの一点から眺めるだけでは分からない構成が見えてきます。